a3df543e964484070a202af9f2da33b2f91e8a00 chinhli Mon Mar 26 15:48:46 2012 -0700 Inithial hgLogin work diff --git src/hg/lib/makefile src/hg/lib/makefile index ebbfcfa..9460c1e 100644 --- src/hg/lib/makefile +++ src/hg/lib/makefile @@ -1,21 +1,21 @@ include ../../inc/common.mk XINC = -I$(MYSQLINC) O = acemblyClass.o affyAllExonProbe.o affyAtlas.o affy10KDetails.o affy120KDetails.o \ affyOffset.o affyPairs.o agp.o agpFrag.o agpGap.o alignSeqSizes.o altGraph.o \ - altGraphX.o ancientRref.o annoStreamDb.o atomDb.o axtInfo.o \ + altGraphX.o ancientRref.o atomDb.o axtInfo.o \ axtLib.o bactigPos.o hgBam.o baseMaskCommon.o bdgpExprLink.o bdgpGeneInfo.o \ bed.o bed5FloatScore.o bed5Pval.o bed6FloatScore.o bed8Attrs.o bed12Source.o \ bed12wSeq.o bedCart.o bgiGeneInfo.o bgiGeneSnp.o bgiSnp.o bioImage.o \ blastTab.o blastzNet.o blatServers.o borf.o borkPseudoHom.o botDelay.o\ cart.o cartDb.o cdsEvidence.o cdsOrtho.o cdsPick.o cdsSpec.o \ ccdsInfo.o ccdsNotes.o ccdsGeneMap.o celeraCoverage.o \ celeraDupPositive.o cgapSage/cgapSage.o cgapSage/cgapSageLib.o cgh.o chainCart.o \ chainDb.o chainLink.o chainNet.o chainNetDbLoad.o \ chicken13kInfo.o chromBins.o chr18deletions.o \ chromGraph.o chromGraphFactory.o chromInfo.o chromInserts.o chromKeeper.o \ clonePos.o codeBlast.o codeBlastScore.o cogs.o cogsxra.o columnInfo.o \ contigAcc.o coordConv.o \ cnpIafrate.o cnpIafrate2.o cnpLocke.o cnpRedon.o cnpSebat.o cnpSebat2.o \ cnpSharp2.o cnpSharpCutoff.o cnpSharpSample.o cnpSharp.o \ cpgIsland.o cpgIslandExt.o ctgPos.o ctgPos2.o \ @@ -88,31 +88,31 @@ spDb.o splignAlign.o stanMad.o stsAlias.o \ stsInfo.o stsInfo2.o stsInfoMouse.o stsInfoMouseNew.o stsInfoRat.o \ stsMap.o stsMapMouse.o stsMapMouseNew.o stsMapRat.o stsMarker.o suggest.o \ switchDbTss.o synMap.o synteny100000.o syntenyBerk.o syntenySanger.o \ sqlProg.o tfbsCons.o tfbsConsSites.o \ tableDescriptions.o tableStatus.o targetDb.o tfbsConsMap.o \ taxonDivision.o taxonGeneticCode.o taxonName.o taxonNode.o taxonXref.o \ tigrCmrGene.o tigrOperon.o tilingPath.o traceInfo.o trackDb.o \ trackDbCustom.o trackHub.o trackLayout.o trackTable.o trackVersion.o trashDir.o \ transRegCode.o transRegCodeCondition.o \ transRegCodeProbe.o txCluster.o txCommon.o txEdgeBed.o \ txEdgeOrtho.o txGraph.o txInfo.o txRnaAccs.o ucscRetroInfo.o ucscRetroOrtho.o \ validateGisaid.o vcfUi.o vegaInfo.o vegaInfoZfish.o visiGene.o vntr.o \ wabAli.o web.o ncRna.o wgRna.o wigAsciiToBinary.o wigDataStream.o wiggle.o \ wiggleCart.o wiggleUtils.o wikiLink.o wikiTrack.o yaleGencodeAssoc.o \ - zdobnovSynt.o oreganno.o \ + zdobnovSynt.o oreganno.o hgLoginLink.o \ oregannoUi.o gvUi.o gv.o omicia.o protVar.o pgSnp.o \ alignInfo.o cddInfo.o loweutils.o cddDesc.o arCOGs.o arcogdesc.o geneTree.o \ megablastInfo.o pgPhenoAssoc.o pgSiftPred.o pgPolyphenPred.o variome.o ifeq (${GBROWSE}, 1) GBROWSE_D=-DGBROWSE else GBROWSE_D= endif %.o: %.c ${CC} ${COPT} ${CFLAGS} ${GBROWSE_D} ${LOWELAB_DEFS} ${HG_DEFS} ${HG_WARN} ${HG_INC} ${XINC} -o $@ -c $< ../../lib/$(MACHTYPE)/jkhgap.a: $(O) ar rcus ../../lib/$(MACHTYPE)/jkhgap.a $(O)