2f75f45421c4854066f7572ac8a9f52e09068f29 kate Fri May 22 15:06:37 2015 -0700 1. Add -test option to use genome-test spec file. 2. Remove unneeded errCatch (from code review). 3. Simplify code org (delibify unshared code); bye to lib/trackHubCheck.c. refs #10015 diff --git src/hg/lib/makefile src/hg/lib/makefile index 0907314..87f7467 100644 --- src/hg/lib/makefile +++ src/hg/lib/makefile @@ -90,31 +90,31 @@ roughAli.o transMapStuff.o transMapInfo.o transMapGene.o transMapSrc.o \ sage.o sageCounts.o sageExp.o samAlignment.o sample.o \ sanger22extra.o sangerGene.o sangerGeneToWBGeneID.o sargassoSeaXra.o \ scopDes.o scoredRef.o search.o sgdAbundance.o \ sgdClone.o sgdDescription.o sgdOther.o simpleNucDiff.o simpleRepeat.o snakeUi.o \ snp.o snp125.o snp125CodingCoordless.o snp132Ext.o snpExceptions.o snpFasta.o snpMap.o snpTmp.o \ snpUi.o snp125Exceptions.o snp125Ui.o softPromoter.o softberryHom.o soTerm.o \ spDb.o splignAlign.o sqlSanity.o stanMad.o stsAlias.o \ stsInfo.o stsInfo2.o stsInfoMouse.o stsInfoMouseNew.o stsInfoRat.o \ stsMap.o stsMapMouse.o stsMapMouseNew.o stsMapRat.o stsMarker.o suggest.o \ switchDbTss.o synMap.o synteny100000.o syntenyBerk.o syntenySanger.o \ sqlProg.o tfbsCons.o tfbsConsSites.o tablesTables.o \ tableDescriptions.o tableStatus.o targetDb.o tfbsConsMap.o \ taxonDivision.o taxonGeneticCode.o taxonName.o taxonNode.o taxonXref.o \ tigrCmrGene.o tigrOperon.o tilingPath.o traceInfo.o trackDb.o \ - trackDbCustom.o trackHub.o trackHubCheck.o trackLayout.o trackTable.o trackVersion.o trashDir.o \ + trackDbCustom.o trackHub.o trackLayout.o trackTable.o trackVersion.o trashDir.o \ transRegCode.o transRegCodeCondition.o \ transRegCodeProbe.o txCluster.o txCommon.o txEdgeBed.o \ txEdgeOrtho.o txGraph.o txInfo.o txRnaAccs.o ucscRetroInfo.o ucscRetroOrtho.o \ validateGisaid.o variant.o vcfUi.o vegaInfo.o vegaInfoZfish.o visiGene.o vntr.o \ wabAli.o web.o ncRna.o wgRna.o wigAsciiToBinary.o wigDataStream.o wiggle.o \ wiggleCart.o wiggleUtils.o wikiLink.o wikiTrack.o yaleGencodeAssoc.o \ zdobnovSynt.o oreganno.o \ oregannoUi.o gvUi.o gv.o omicia.o protVar.o pgSnp.o \ alignInfo.o cddInfo.o loweutils.o cddDesc.o arCOGs.o arcogdesc.o geneTree.o \ megablastInfo.o pgPhenoAssoc.o pgSiftPred.o pgPolyphenPred.o userRegions.o variome.o ifeq (${GBROWSE}, 1) GBROWSE_D=-DGBROWSE else GBROWSE_D=