5cc4a16511d6a2980e27a1225e2f90c72b5ea077 galt Wed Apr 26 14:19:28 2017 -0700 -Renaming sha1 to rSha1 etc to avoid silent name collision during linking. diff --git src/lib/makefile src/lib/makefile index 3e9b925..6dd08d4 100644 --- src/lib/makefile +++ src/lib/makefile @@ -27,33 +27,33 @@ gapCalc.o gdf.o gemfont.o genomeRangeTree.o \ gfNet.o gff.o gff3.o gfxPoly.o gifLabel.o \ hacTree.o hash.o hex.o histogram.o hmmPfamParse.o hmmstats.o htmlColor.o htmlPage.o htmshell.o \ hmac.o https.o intExp.o intValTree.o internet.o itsa.o iupac.o \ jointalign.o jpegSize.o jsonParse.o jsonWrite.o \ keys.o knetUdc.o kxTok.o linefile.o lineFileOnBigBed.o localmem.o log.o longToList.o \ maf.o mafFromAxt.o mafScore.o mailViaPipe.o md5.o memalloc.o \ memgfx.o meta.o metaWig.o mgCircle.o \ mgPolygon.o mime.o net.o nib.o nibTwo.o nt4.o numObscure.o \ obscure.o oldGff.o oligoTm.o options.o osunix.o pairHmm.o pairDistance.o \ paraFetch.o peakCluster.o \ phyloTree.o pipeline.o portimpl.o pngwrite.o psGfx.o psPoly.o pscmGfx.o \ psl.o pslGenoShow.o pslShow.o pslTbl.o pslTransMap.o pthreadDoList.o pthreadWrap.o \ qa.o quickHeap.o quotedP.o \ ra.o rainbow.o raToStruct.o rbTree.o rangeTree.o regexHelper.o repMask.o \ - rle.o rnautil.o rqlEval.o rqlParse.o rudp.o \ + rle.o rnautil.o rqlEval.o rqlParse.o rSha1.o rudp.o \ scoreWindow.o seg.o seqOut.o seqStats.o servBrcMcw.o servCrunx.o \ - servcis.o servcl.o servmsII.o servpws.o sha1.o shaRes.o slog.o snof.o \ + servcis.o servcl.o servmsII.o servpws.o shaRes.o slog.o snof.o \ snofmake.o snofsig.o spaceSaver.o spacedColumn.o spacedSeed.o \ splatAli.o sqlList.o sqlNum.o sqlReserved.o subText.o sufa.o sufx.o synQueue.o \ tabRow.o tagStorm.o tagToSql.o textOut.o tokenizer.o trix.o twoBit.o \ udc.o vcf.o vcfBits.o vGfx.o vPng.o verbose.o \ wildcmp.o wormdna.o \ xAli.o xa.o xap.o xenshow.o xmlEscape.o xp.o zlibFace.o $(MACHTYPE)/jkweb.a: $(O) $(MACHTYPE) ar rcus $(MACHTYPE)/jkweb.a $(O) $(MACHTYPE): mkdir $(MACHTYPE) test: cd tests && ${MAKE} test