a3939547c53f1ccb39910e61bfa90a0c54310273
kent
  Tue Jan 5 00:40:36 2021 -0800
First cut of vRowMatrix to stream through a variety of matrices semi-transparently I hope.  FOr now just handles tsv though.

diff --git src/lib/makefile src/lib/makefile
index 841030d..1c87f76 100644
--- src/lib/makefile
+++ src/lib/makefile
@@ -31,33 +31,33 @@
     jointalign.o jpegSize.o jsonParse.o jsonQuery.o jsonWrite.o \
     keys.o knetUdc.o kxTok.o linefile.o lineFileOnBigBed.o localmem.o log.o longTabix.o longToList.o \
     maf.o mafFromAxt.o mafScore.o mailViaPipe.o md5.o \
     matrixMarket.o memalloc.o memgfx.o meta.o metaWig.o mgCircle.o \
     mgPolygon.o mime.o net.o nib.o nibTwo.o nt4.o numObscure.o \
     obscure.o oldGff.o oligoTm.o options.o osunix.o pairHmm.o pairDistance.o \
     paraFetch.o peakCluster.o \
     phyloTree.o pipeline.o portimpl.o pngwrite.o psGfx.o psPoly.o pscmGfx.o \
     psl.o pslGenoShow.o pslShow.o pslTbl.o pslTransMap.o pthreadDoList.o pthreadWrap.o \
     qa.o quickHeap.o quotedP.o \
     ra.o rainbow.o raToStruct.o rbTree.o rangeTree.o regexHelper.o repMask.o \
     rle.o rnautil.o rqlEval.o rqlParse.o rqlToSql.o rudp.o \
     scoreWindow.o seg.o seqOut.o seqStats.o servBrcMcw.o servCrunx.o \
     servcis.o servcl.o servmsII.o servpws.o shaRes.o slog.o snof.o \
     snofmake.o snofsig.o spaceSaver.o spacedColumn.o spacedSeed.o \
-    splatAli.o sqlList.o sqlNum.o sqlReserved.o strex.o subText.o sufa.o sufx.o synQueue.o \
+    sparseMatrix.o splatAli.o sqlList.o sqlNum.o sqlReserved.o strex.o subText.o sufa.o sufx.o synQueue.o \
     tabRow.o tagSchema.o tagStorm.o tagToJson.o tagToSql.o textOut.o tokenizer.o trix.o twoBit.o \
-    udc.o uuid.o vcf.o vcfBits.o vGfx.o vPng.o verbose.o \
+    udc.o uuid.o vcf.o vcfBits.o vGfx.o vPng.o verbose.o vMatrix.o \
     wildcmp.o windowsToAscii.o wormdna.o \
     xAli.o xa.o xap.o xenshow.o xmlEscape.o xp.o zlibFace.o
 
 $(MACHTYPE)/jkweb.a: $(O) $(MACHTYPE)
 	ar rcus $(MACHTYPE)/jkweb.a $(O)
 
 $(MACHTYPE):
 	mkdir $(MACHTYPE)
 
 test:
 	cd tests && ${MAKE} test
 
 clean:
 	rm -f ${O} $(MACHTYPE)/jkweb.a
 	cd tests && ${MAKE} clean