95030f73f067d8e8f9221a09c1811784607e4e72 markd Fri Jul 10 17:51:29 2020 -0700 split dynamic server genomeDataPrefix into genome and genomeDataDir. More verbose, but clearer diff --git src/gfServer/tests/expected/testDynServerTrans.out src/gfServer/tests/expected/testDynServerTrans.out index 917da35..d684d8f 100644 --- src/gfServer/tests/expected/testDynServerTrans.out +++ src/gfServer/tests/expected/testDynServerTrans.out @@ -1,16 +1,16 @@ -0ddf270562684f29transQuery 1540 crea +0ddf270562684f29transQuery 1540 crea crea tileSize 11 0 104 crea.2bit:hCreaGeno 80 184 23 + 0 0 0 80 8 88 12 92 16 96 20 100 24 104 28 108 32 112 36 116 44 124 48 128 52 132 56 136 60 140 64 144 68 148 72 152 76 156 80 160 84 164 88 168 96 176 100 180 309 345 crea.2bit:hCreaGeno 868 904 6 + 0 0 309 868 313 872 321 880 325 884 333 892 341 900 179 199 crea.2bit:hCreaGeno 528 548 4 + 0 0 179 528 183 532 191 540 195 544 366 382 crea.2bit:mCreatGeno 2092 2108 3 + 0 0 366 2092 374 2100 378 2104 395 415 crea.2bit:mCreatGeno 2176 2196 3 + 0 0 395 2176 399 2180 411 2192 433 505 crea.2bit:hCreaGeno 1780 1852 15 + 0 1 433 1780 437 1784 441 1788 453 1800 457 1804 461 1808 465 1812 469 1816 473 1820 477 1824 481 1828 485 1832 493 1840 497 1844 501 1848 107 163 crea.2bit:hCreaGeno 388 444 14 + 0 1 @@ -78,31 +78,31 @@ 279 303 crea.2bit:hCreaGeno 800 824 5 + 2 1 279 800 283 804 291 812 295 816 299 820 53 73 crea.2bit:mCreatGeno 856 876 3 + 2 1 53 856 57 860 69 872 0 100 crea.2bit:hCreaGeno 80 180 23 + 2 2 0 80 4 84 8 88 12 92 16 96 20 100 24 104 28 108 32 112 36 116 40 120 44 124 52 132 56 136 60 140 64 144 68 148 72 152 80 160 84 164 88 168 92 172 96 176 205 273 crea.2bit:mCreatGeno 1424 1492 7 + 2 2 205 1424 209 1428 217 1436 241 1460 253 1472 261 1480 269 1488 305 345 crea.2bit:hCreaGeno 864 904 6 + 2 2 305 864 317 876 325 884 333 892 337 896 341 900 354 386 crea.2bit:mCreatGeno 2080 2112 5 + 2 2 354 2080 358 2084 370 2096 374 2100 382 2108 171 191 crea.2bit:hCreaGeno 520 540 4 + 2 2 171 520 179 528 183 532 187 536 end -0ddf270562684f29transQuery 1606 crea +0ddf270562684f29transQuery 1606 crea crea tileSize 11 452 528 crea.2bit:mCreatGeno 2348 2424 16 + 0 0 452 2348 456 2352 464 2360 468 2364 472 2368 476 2372 480 2376 484 2380 488 2384 492 2388 496 2392 500 2396 508 2404 512 2408 516 2412 524 2420 122 186 crea.2bit:mCreatGeno 1104 1168 14 + 0 0 122 1104 126 1108 130 1112 138 1120 142 1124 146 1128 150 1132 158 1140 162 1144 166 1148 170 1152 174 1156 178 1160 182 1164 123 187 crea.2bit:hCreaGeno 388 452 12 + 0 0 123 388 127 392 131 396 139 404 143 408 147 412 151 416 167 432 171 436 175 440 179 444 183 448 296 320 crea.2bit:mCreatGeno 1540 1564 5 + 0 0 296 1540 300 1544 308 1552 312 1556 316 1560 1 117 crea.2bit:mCreatGeno 788 904 26 + 0 1 1 788 5 792 9 796 13 800 17 804 25 812 29 816 33 820 37 824 41 828 45 832 49 836 57 844 61 848 65 852 69 856 73 860 77 864 81 868 85 872 89 876 93 880 97 884 101 888 109 896 113 900 321 361 crea.2bit:mCreatGeno 1604 1644 8 + 0 1 321 1604 325 1608 333 1616 337 1620 341 1624 345 1628 353 1636 357 1640 223 291 crea.2bit:hCreaGeno 684 752 6 + 0 1 @@ -174,23 +174,23 @@ 186 218 crea.2bit:mCreatGeno 1224 1256 8 + 2 1 186 1224 190 1228 194 1232 198 1236 202 1240 206 1244 210 1248 214 1252 191 215 crea.2bit:hCreaGeno 524 548 6 + 2 1 191 524 195 528 199 532 203 536 207 540 211 544 119 187 crea.2bit:hCreaGeno 384 452 17 + 2 2 119 384 123 388 127 392 131 396 135 400 139 404 143 408 147 412 151 416 155 420 159 424 163 428 167 432 171 436 175 440 179 444 183 448 118 186 crea.2bit:mCreatGeno 1100 1168 17 + 2 2 118 1100 122 1104 126 1108 130 1112 134 1116 138 1120 142 1124 146 1128 150 1132 154 1136 158 1140 162 1144 166 1148 170 1152 174 1156 178 1160 182 1164 452 528 crea.2bit:mCreatGeno 2348 2424 17 + 2 2 452 2348 456 2352 460 2356 464 2360 468 2364 472 2368 476 2372 480 2376 488 2384 496 2392 500 2396 504 2400 508 2404 512 2408 516 2412 520 2416 524 2420 449 477 crea.2bit:hCreaGeno 1780 1808 7 + 2 2 449 1780 453 1784 457 1788 461 1792 465 1796 469 1800 473 1804 292 320 crea.2bit:mCreatGeno 1536 1564 7 + 2 2 292 1536 296 1540 300 1544 304 1548 308 1552 312 1556 316 1560 end -0ddf270562684f29transInfo crea +0ddf270562684f29transInfo crea crea version 36x7 type translated tileSize 4 stepSize 4 minMatch 3 end