ee8ef81c6d82157859f16548a27726f4b7421891 markd Mon Jul 6 19:22:14 2020 -0700 added support for perSeqMax in dynamic server diff --git src/gfServer/tests/expected/testDynServerTrans.out src/gfServer/tests/expected/testDynServerTrans.out new file mode 100644 index 0000000..917da35 --- /dev/null +++ src/gfServer/tests/expected/testDynServerTrans.out @@ -0,0 +1,196 @@ +0ddf270562684f29transQuery 1540 crea + +tileSize 11 +0 104 crea.2bit:hCreaGeno 80 184 23 + 0 0 + 0 80 8 88 12 92 16 96 20 100 24 104 28 108 32 112 36 116 44 124 48 128 52 132 56 136 60 140 64 144 68 148 72 152 76 156 80 160 84 164 88 168 96 176 100 180 +309 345 crea.2bit:hCreaGeno 868 904 6 + 0 0 + 309 868 313 872 321 880 325 884 333 892 341 900 +179 199 crea.2bit:hCreaGeno 528 548 4 + 0 0 + 179 528 183 532 191 540 195 544 +366 382 crea.2bit:mCreatGeno 2092 2108 3 + 0 0 + 366 2092 374 2100 378 2104 +395 415 crea.2bit:mCreatGeno 2176 2196 3 + 0 0 + 395 2176 399 2180 411 2192 +433 505 crea.2bit:hCreaGeno 1780 1852 15 + 0 1 + 433 1780 437 1784 441 1788 453 1800 457 1804 461 1808 465 1812 469 1816 473 1820 477 1824 481 1828 485 1832 493 1840 497 1844 501 1848 +107 163 crea.2bit:hCreaGeno 388 444 14 + 0 1 + 107 388 111 392 115 396 119 400 123 404 127 408 131 412 135 416 139 420 143 424 147 428 151 432 155 436 159 440 +106 162 crea.2bit:mCreatGeno 1104 1160 11 + 0 1 + 106 1104 110 1108 114 1112 118 1116 122 1120 126 1124 130 1128 134 1132 150 1148 154 1152 158 1156 +203 275 crea.2bit:hCreaGeno 680 752 12 + 0 2 + 203 680 211 688 219 696 223 700 227 704 231 708 235 712 239 716 243 720 247 724 255 732 271 748 +393 433 crea.2bit:hCreaGeno 1672 1712 9 + 0 2 + 393 1672 397 1676 401 1680 405 1684 409 1688 413 1692 417 1696 425 1704 429 1708 +348 388 crea.2bit:hCreaGeno 1460 1500 8 + 0 2 + 348 1460 352 1464 356 1468 364 1476 368 1480 376 1488 380 1492 384 1496 +284 304 crea.2bit:hCreaGeno 804 824 5 + 0 2 + 284 804 288 808 292 812 296 816 300 820 +54 74 crea.2bit:mCreatGeno 856 876 3 + 0 2 + 54 856 58 860 70 872 +202 274 crea.2bit:hCreaGeno 680 752 18 + 1 0 + 202 680 206 684 210 688 214 692 218 696 222 700 226 704 230 708 234 712 238 716 242 720 246 724 250 728 254 732 258 736 262 740 266 744 270 748 +347 391 crea.2bit:hCreaGeno 1460 1504 11 + 1 0 + 347 1460 351 1464 355 1468 359 1472 363 1476 367 1480 371 1484 375 1488 379 1492 383 1496 387 1500 +392 432 crea.2bit:hCreaGeno 1672 1712 10 + 1 0 + 392 1672 396 1676 400 1680 404 1684 408 1688 412 1692 416 1696 420 1700 424 1704 428 1708 +308 344 crea.2bit:mCreatGeno 1608 1644 9 + 1 0 + 308 1608 312 1612 316 1616 320 1620 324 1624 328 1628 332 1632 336 1636 340 1640 +53 89 crea.2bit:mCreatGeno 856 892 7 + 1 0 + 53 856 57 860 61 864 65 868 69 872 73 876 85 888 +279 303 crea.2bit:hCreaGeno 800 824 6 + 1 0 + 279 800 283 804 287 808 291 812 295 816 299 820 +0 100 crea.2bit:hCreaGeno 80 180 24 + 1 1 + 0 80 4 84 8 88 12 92 16 96 24 104 28 108 32 112 36 116 40 120 44 124 48 128 52 132 56 136 60 140 64 144 68 148 72 152 76 156 80 160 84 164 88 168 92 172 96 176 +205 273 crea.2bit:mCreatGeno 1424 1492 17 + 1 1 + 205 1424 209 1428 213 1432 217 1436 221 1440 225 1444 229 1448 233 1452 237 1456 241 1460 245 1464 249 1468 253 1472 257 1476 261 1480 265 1484 269 1488 +305 345 crea.2bit:hCreaGeno 864 904 10 + 1 1 + 305 864 309 868 313 872 317 876 321 880 325 884 329 888 333 892 337 896 341 900 +350 390 crea.2bit:mCreatGeno 2076 2116 10 + 1 1 + 350 2076 354 2080 358 2084 362 2088 366 2092 370 2096 374 2100 378 2104 382 2108 386 2112 +395 431 crea.2bit:mCreatGeno 2176 2212 8 + 1 1 + 395 2176 399 2180 403 2184 407 2188 411 2192 419 2200 423 2204 427 2208 +171 199 crea.2bit:hCreaGeno 520 548 7 + 1 1 + 171 520 175 524 179 528 183 532 187 536 191 540 195 544 +174 202 crea.2bit:mCreatGeno 1228 1256 7 + 1 1 + 174 1228 178 1232 182 1236 186 1240 190 1244 194 1248 198 1252 +103 171 crea.2bit:hCreaGeno 384 452 17 + 1 2 + 103 384 107 388 111 392 115 396 119 400 123 404 127 408 131 412 135 416 139 420 143 424 147 428 151 432 155 436 159 440 163 444 167 448 +433 509 crea.2bit:hCreaGeno 1780 1856 17 + 1 2 + 433 1780 437 1784 441 1788 445 1792 449 1796 453 1800 457 1804 461 1808 465 1812 473 1820 481 1828 485 1832 489 1836 493 1840 497 1844 501 1848 505 1852 +102 170 crea.2bit:mCreatGeno 1100 1168 17 + 1 2 + 102 1100 106 1104 110 1108 114 1112 118 1116 122 1120 126 1124 130 1128 134 1132 138 1136 142 1140 146 1144 150 1148 154 1152 158 1156 162 1160 166 1164 +276 304 crea.2bit:mCreatGeno 1536 1564 7 + 1 2 + 276 1536 280 1540 284 1544 288 1548 292 1552 296 1556 300 1560 +436 460 crea.2bit:mCreatGeno 2348 2372 6 + 1 2 + 436 2348 440 2352 444 2356 448 2360 452 2364 456 2368 +432 508 crea.2bit:hCreaGeno 1780 1856 16 + 2 0 + 432 1780 436 1784 448 1796 452 1800 456 1804 460 1808 464 1812 468 1816 476 1824 480 1828 484 1832 488 1836 492 1840 496 1844 500 1848 504 1852 +106 170 crea.2bit:hCreaGeno 388 452 14 + 2 0 + 106 388 110 392 114 396 122 404 126 408 130 412 134 416 142 424 146 428 150 432 154 436 158 440 162 444 166 448 +105 169 crea.2bit:mCreatGeno 1104 1168 12 + 2 0 + 105 1104 109 1108 113 1112 121 1120 125 1124 129 1128 133 1132 149 1148 153 1152 157 1156 161 1160 165 1164 +202 274 crea.2bit:hCreaGeno 680 752 15 + 2 1 + 202 680 206 684 210 688 214 692 218 696 222 700 226 704 230 708 234 712 238 716 242 720 254 732 258 736 266 744 270 748 +347 387 crea.2bit:hCreaGeno 1460 1500 9 + 2 1 + 347 1460 351 1464 355 1468 359 1472 363 1476 371 1484 375 1488 379 1492 383 1496 +392 428 crea.2bit:hCreaGeno 1672 1708 8 + 2 1 + 392 1672 396 1676 404 1684 408 1688 412 1692 416 1696 420 1700 424 1704 +279 303 crea.2bit:hCreaGeno 800 824 5 + 2 1 + 279 800 283 804 291 812 295 816 299 820 +53 73 crea.2bit:mCreatGeno 856 876 3 + 2 1 + 53 856 57 860 69 872 +0 100 crea.2bit:hCreaGeno 80 180 23 + 2 2 + 0 80 4 84 8 88 12 92 16 96 20 100 24 104 28 108 32 112 36 116 40 120 44 124 52 132 56 136 60 140 64 144 68 148 72 152 80 160 84 164 88 168 92 172 96 176 +205 273 crea.2bit:mCreatGeno 1424 1492 7 + 2 2 + 205 1424 209 1428 217 1436 241 1460 253 1472 261 1480 269 1488 +305 345 crea.2bit:hCreaGeno 864 904 6 + 2 2 + 305 864 317 876 325 884 333 892 337 896 341 900 +354 386 crea.2bit:mCreatGeno 2080 2112 5 + 2 2 + 354 2080 358 2084 370 2096 374 2100 382 2108 +171 191 crea.2bit:hCreaGeno 520 540 4 + 2 2 + 171 520 179 528 183 532 187 536 +end +0ddf270562684f29transQuery 1606 crea + +tileSize 11 +452 528 crea.2bit:mCreatGeno 2348 2424 16 + 0 0 + 452 2348 456 2352 464 2360 468 2364 472 2368 476 2372 480 2376 484 2380 488 2384 492 2388 496 2392 500 2396 508 2404 512 2408 516 2412 524 2420 +122 186 crea.2bit:mCreatGeno 1104 1168 14 + 0 0 + 122 1104 126 1108 130 1112 138 1120 142 1124 146 1128 150 1132 158 1140 162 1144 166 1148 170 1152 174 1156 178 1160 182 1164 +123 187 crea.2bit:hCreaGeno 388 452 12 + 0 0 + 123 388 127 392 131 396 139 404 143 408 147 412 151 416 167 432 171 436 175 440 179 444 183 448 +296 320 crea.2bit:mCreatGeno 1540 1564 5 + 0 0 + 296 1540 300 1544 308 1552 312 1556 316 1560 +1 117 crea.2bit:mCreatGeno 788 904 26 + 0 1 + 1 788 5 792 9 796 13 800 17 804 25 812 29 816 33 820 37 824 41 828 45 832 49 836 57 844 61 848 65 852 69 856 73 860 77 864 81 868 85 872 89 876 93 880 97 884 101 888 109 896 113 900 +321 361 crea.2bit:mCreatGeno 1604 1644 8 + 0 1 + 321 1604 325 1608 333 1616 337 1620 341 1624 345 1628 353 1636 357 1640 +223 291 crea.2bit:hCreaGeno 684 752 6 + 0 1 + 223 684 227 688 235 696 259 720 271 732 287 748 +372 396 crea.2bit:hCreaGeno 1468 1492 4 + 0 1 + 372 1468 376 1472 388 1484 392 1488 +413 433 crea.2bit:hCreaGeno 1676 1696 3 + 0 1 + 413 1676 425 1688 429 1692 +222 290 crea.2bit:mCreatGeno 1424 1492 13 + 0 2 + 222 1424 226 1428 230 1432 234 1436 238 1440 242 1444 246 1448 250 1452 258 1460 270 1472 274 1476 278 1480 286 1488 +408 448 crea.2bit:mCreatGeno 2172 2212 9 + 0 2 + 408 2172 412 2176 420 2184 424 2188 428 2192 432 2196 436 2200 440 2204 444 2208 +367 403 crea.2bit:mCreatGeno 2076 2112 7 + 0 2 + 367 2076 371 2080 375 2084 387 2096 391 2100 395 2104 399 2108 +187 219 crea.2bit:mCreatGeno 1224 1256 6 + 0 2 + 187 1224 191 1228 199 1236 203 1240 211 1248 215 1252 +68 88 crea.2bit:hCreaGeno 132 152 3 + 0 2 + 68 132 72 136 84 148 +322 358 crea.2bit:hCreaGeno 864 900 3 + 0 2 + 322 864 350 892 354 896 +229 289 crea.2bit:mCreatGeno 1432 1492 13 + 1 0 + 229 1432 233 1436 237 1440 241 1444 245 1448 249 1452 253 1456 257 1460 261 1464 265 1468 273 1476 281 1484 285 1488 +362 406 crea.2bit:mCreatGeno 2072 2116 9 + 1 0 + 362 2072 366 2076 370 2080 378 2088 382 2092 390 2100 394 2104 398 2108 402 2112 +411 447 crea.2bit:mCreatGeno 2176 2212 7 + 1 0 + 411 2176 415 2180 419 2184 423 2188 427 2192 431 2196 443 2208 +71 87 crea.2bit:hCreaGeno 136 152 3 + 1 0 + 71 136 75 140 83 148 +452 528 crea.2bit:mCreatGeno 2348 2424 18 + 1 1 + 452 2348 456 2352 460 2356 468 2364 472 2368 476 2372 480 2376 484 2380 488 2384 492 2388 496 2392 500 2396 504 2400 508 2404 512 2408 516 2412 520 2416 524 2420 +122 178 crea.2bit:mCreatGeno 1104 1160 14 + 1 1 + 122 1104 126 1108 130 1112 134 1116 138 1120 142 1124 146 1128 150 1132 154 1136 158 1140 162 1144 166 1148 170 1152 174 1156 +123 179 crea.2bit:hCreaGeno 388 444 11 + 1 1 + 123 388 127 392 131 396 135 400 139 404 143 408 147 412 151 416 167 432 171 436 175 440 +300 320 crea.2bit:mCreatGeno 1544 1564 4 + 1 1 + 300 1544 304 1548 308 1552 316 1560 +1 117 crea.2bit:mCreatGeno 788 904 25 + 1 2 + 1 788 5 792 9 796 17 804 25 812 29 816 33 820 37 824 41 828 45 832 49 836 53 840 61 848 65 852 69 856 73 860 77 864 81 868 85 872 89 876 93 880 97 884 101 888 105 892 113 900 +325 361 crea.2bit:mCreatGeno 1608 1644 7 + 1 2 + 325 1608 329 1612 337 1620 341 1624 345 1628 349 1632 357 1640 +227 291 crea.2bit:hCreaGeno 688 752 6 + 1 2 + 227 688 235 696 247 708 259 720 271 732 287 748 +409 433 crea.2bit:hCreaGeno 1672 1696 4 + 1 2 + 409 1672 413 1676 425 1688 429 1692 +372 396 crea.2bit:hCreaGeno 1468 1492 3 + 1 2 + 372 1468 384 1480 392 1488 +0 116 crea.2bit:mCreatGeno 788 904 25 + 2 0 + 0 788 4 792 8 796 12 800 16 804 28 816 32 820 36 824 40 828 44 832 52 840 56 844 64 852 68 856 72 860 76 864 80 868 84 872 88 876 92 880 96 884 100 888 104 892 108 896 112 900 +218 290 crea.2bit:hCreaGeno 680 752 18 + 2 0 + 218 680 222 684 226 688 230 692 234 696 238 700 242 704 246 708 250 712 254 716 258 720 262 724 266 728 270 732 274 736 278 740 282 744 286 748 +367 407 crea.2bit:hCreaGeno 1464 1504 10 + 2 0 + 367 1464 371 1468 375 1472 379 1476 383 1480 387 1484 391 1488 395 1492 399 1496 403 1500 +324 360 crea.2bit:mCreatGeno 1608 1644 9 + 2 0 + 324 1608 328 1612 332 1616 336 1620 340 1624 344 1628 348 1632 352 1636 356 1640 +412 448 crea.2bit:hCreaGeno 1676 1712 8 + 2 0 + 412 1676 416 1680 420 1684 424 1688 428 1692 436 1700 440 1704 444 1708 +295 319 crea.2bit:hCreaGeno 800 824 6 + 2 0 + 295 800 299 804 303 808 307 812 311 816 315 820 +221 289 crea.2bit:mCreatGeno 1424 1492 17 + 2 1 + 221 1424 225 1428 229 1432 233 1436 237 1440 241 1444 245 1448 249 1452 253 1456 257 1460 261 1464 265 1468 269 1472 273 1476 277 1480 281 1484 285 1488 +362 406 crea.2bit:mCreatGeno 2072 2116 11 + 2 1 + 362 2072 366 2076 370 2080 374 2084 378 2088 382 2092 386 2096 390 2100 394 2104 398 2108 402 2112 +321 361 crea.2bit:hCreaGeno 864 904 10 + 2 1 + 321 864 325 868 329 872 333 876 337 880 341 884 345 888 349 892 353 896 357 900 +407 447 crea.2bit:mCreatGeno 2172 2212 10 + 2 1 + 407 2172 411 2176 415 2180 419 2184 423 2188 427 2192 431 2196 435 2200 439 2204 443 2208 +67 103 crea.2bit:hCreaGeno 132 168 8 + 2 1 + 67 132 71 136 75 140 79 144 83 148 87 152 91 156 99 164 +186 218 crea.2bit:mCreatGeno 1224 1256 8 + 2 1 + 186 1224 190 1228 194 1232 198 1236 202 1240 206 1244 210 1248 214 1252 +191 215 crea.2bit:hCreaGeno 524 548 6 + 2 1 + 191 524 195 528 199 532 203 536 207 540 211 544 +119 187 crea.2bit:hCreaGeno 384 452 17 + 2 2 + 119 384 123 388 127 392 131 396 135 400 139 404 143 408 147 412 151 416 155 420 159 424 163 428 167 432 171 436 175 440 179 444 183 448 +118 186 crea.2bit:mCreatGeno 1100 1168 17 + 2 2 + 118 1100 122 1104 126 1108 130 1112 134 1116 138 1120 142 1124 146 1128 150 1132 154 1136 158 1140 162 1144 166 1148 170 1152 174 1156 178 1160 182 1164 +452 528 crea.2bit:mCreatGeno 2348 2424 17 + 2 2 + 452 2348 456 2352 460 2356 464 2360 468 2364 472 2368 476 2372 480 2376 488 2384 496 2392 500 2396 504 2400 508 2404 512 2408 516 2412 520 2416 524 2420 +449 477 crea.2bit:hCreaGeno 1780 1808 7 + 2 2 + 449 1780 453 1784 457 1788 461 1792 465 1796 469 1800 473 1804 +292 320 crea.2bit:mCreatGeno 1536 1564 7 + 2 2 + 292 1536 296 1540 300 1544 304 1548 308 1552 312 1556 316 1560 +end +0ddf270562684f29transInfo crea + +version 36x7 +type translated +tileSize 4 +stepSize 4 +minMatch 3 +end