42ccdd815277a3dc7d78b48fa0ac36d469ab628a
markd
  Mon Feb 28 19:07:04 2022 -0800
added bigRmsk autoSql files from Robert Hubley

diff --git src/hg/lib/makefile src/hg/lib/makefile
index ce4c202..557e096 100644
--- src/hg/lib/makefile
+++ src/hg/lib/makefile
@@ -24,31 +24,31 @@
   genePred.o genePredReader.o geoMirror.o ggCluster.o ggDump.o ggGraph.o ggMrnaAli.o ggTypes.o glDbRep.o \
   googleAnalytics.o gpFx.o grp.o gtexAse.o gtexDonor.o gtexGeneBed.o gtexInfo.o gtexSample.o \
   gtexSampleData.o gtexTissue.o gtexTissueMedian.o gtexUi.o hCommon.o hPrint.o hVarSubst.o \
   hapmapAllelesOrtho.o hapmapPhaseIIISummary.o hapmapSnps.o hdb.o hgColors.o hgConfig.o hgFind.o \
   hgFindSpec.o hgFindSpecCustom.o hgHgvs.o hgHgvsParse.o hgMaf.o hgRelate.o hic.o hicUi.o hubConnect.o hubPublic.o \
   hubSearchText.o hui.o imageClone.o indelShift.o interact.o interactUi.o itemAttr.o jksql.o joiner.o \
   jsHelper.o kgAlias.o kgProtAlias.o kgXref.o knownInfo.o knownMore.o lav.o lfs.o liftOver.o liftOverChain.o \
   liftUp.o longRange.o lrg.o lsSnpPdb.o mafFrames.o mafGene.o mafSummary.o makeItemsItem.o mdb.o \
   microarray.o minChromSize.o netAlign.o netCart.o pepPred.o pgPhenoAssoc.o pgSnp.o pslReader.o qaSeq.o \
   rankProp.o refLink.o rikenCluster.o rmskAlign.o rmskJoined.o rmskOut.o rmskOut2.o rnaGene.o sage.o sageCounts.o samAlignment.o \
   sample.o sanger22extra.o scoredRef.o seqWindow.o snakeUi.o snp.o snpExceptions.o soTerm.o spDb.o sqlProg.o \
   sqlSanity.o stanMad.o stsAlias.o stsInfo2.o stsMap.o stsMarker.o tableStatus.o tablesTables.o \
   tagRepo.o tfbsCons.o tigrCmrGene.o traceInfo.o trackDb.o trackDbCache.o trackDbCustom.o trackHub.o \
   trackVersion.o trashDir.o txAliDiff.o txCluster.o txCommon.o txEdgeBed.o txGraph.o txInfo.o txRnaAccs.o \
   variantProjector.o vcfUi.o vegaInfo.o web.o wigAsciiToBinary.o wigDataStream.o wiggle.o wiggleCart.o \
-  wiggleUtils.o wikiLink.o
+  wiggleUtils.o wikiLink.o bigRmskAlignBed.o bigRmskBed.o
 
 ifeq (${USE_HIC}, 1)
   O += straw.o
 endif
 
 ifeq (${GBROWSE}, 1)
   GBROWSE_D=-DGBROWSE
 else
   GBROWSE_D=
 endif
 
 %.o: %.c
 	${CC} ${COPT} ${CFLAGS} ${GBROWSE_D} ${LOWELAB_DEFS} ${HG_DEFS} ${HG_WARN} ${HG_INC} ${XINC} -o $@ -c $<
 
 ../../lib/$(MACHTYPE)/jkhgap.a: $(O) libDir