39b563455274f8e71dce53a9f8d9f8f5ad7d7832 hiram Fri Sep 30 10:37:37 2022 -0700 testing the URL input option refs #29819 diff --git src/hg/makeDb/hgLoadOut/tests/makefile src/hg/makeDb/hgLoadOut/tests/makefile index c2114f2..0041f80 100644 --- src/hg/makeDb/hgLoadOut/tests/makefile +++ src/hg/makeDb/hgLoadOut/tests/makefile @@ -1,10 +1,28 @@ -test: - @hgLoadOut -tabFile=chrCp.rmsk.tab -table=rmsk test chrCp.fa.out.gz +test: test0 test1 + +test0: + hgLoadOut -tabFile=chrCp.rmsk.tab -table=rmsk test chrCp.fa.out.gz @diff chrCp.expected.tab chrCp.rmsk.tab @rm -f chrCp.rmsk.tab - @zcat chrCp.fa.out.gz | hgLoadOut -tabFile=chrCp.rmsk.tab -table=rmsk test stdin + +test1: + zcat chrCp.fa.out.gz | hgLoadOut -tabFile=chrCp.rmsk.tab -table=rmsk test stdin @diff chrCp.expected.tab chrCp.rmsk.tab + @rm -f chrCp.rmsk.tab + +test2: + hgLoadOut -tabFile=triCas2.rmsk.tab -table=rmsk test https://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/triCas2/bigZips/triCas2.fa.out.gz + md5sum triCas2.rmsk.tab > triCas2.md5sum + diff triCas2.md5sum triCas2.expected.md5sum + @rm -f triCas2.rmsk.tab triCas2.md5sum + +test3: + hgLoadOut -tabFile=stdout -table=rmsk test https://hgdownload.soe.ucsc.edu/hubs/GCA/001/708/105/GCA_001708105.1/GCA_001708105.1.repeatMasker.out.gz | gzip -c > GCA_001708105.1.rmsk.tab.gz + zdiff GCA_001708105.1.rmsk.tab.gz GCA_001708105.1.expected.tab.gz + @rm -f GCA_001708105.1.rmsk.tab.gz clean:: rm -f chrCp.rmsk.tab + rm -f triCas2.rmsk.tab triCas2.md5sum + rm -f GCA_001708105.1.rmsk.tab.gz