b31907d700c1fe956e4e4c20e64d91de027d7c84 markd Tue May 14 02:03:33 2024 -0700 merge blatHuge implementation diff --git src/gfServer/tests/expected/testHugeUntrans.out src/gfServer/tests/expected/testHugeUntrans.out new file mode 100644 index 0000000..0e51b67 --- /dev/null +++ src/gfServer/tests/expected/testHugeUntrans.out @@ -0,0 +1,102 @@ +3581 5473 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 388027310 388029202 32 +43 494 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 386479247 386479698 15 +1472 1670 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387468026 387468224 8 +3035 3211 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387902724 387902900 8 +1100 1210 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387199340 387199450 7 +2201 2300 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387585968 387586067 7 +1759 1869 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387546720 387546830 6 +944 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387193004 387193103 5 +2820 2897 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387779909 387779986 5 +2939 3027 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387887368 387887456 5 +1674 1762 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387520463 387520551 4 +1974 2117 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387559810 387559953 4 +2423 2500 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387677873 387677950 4 +3248 3358 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387976567 387976677 4 +943 1042 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 1668366062 1668366161 3 +977 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056727.1 1029409821 1029409887 3 +947 1036 GCF_019279795.1.2bit:NC_056728.1 1888446219 1888446307 3 +1008 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056730.1 629347092 629347125 3 +999 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056731.1 1422833588 1422833632 3 +997 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056731.1 1537190149 1537190193 3 +977 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056733.1 1240629841 1240629907 3 +964 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056733.1 1803876371 1803876448 3 +977 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056734.1 265558084 265558150 3 +1008 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056735.1 106047722 106047755 3 +1000 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056735.1 480621031 480621075 3 +1000 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056736.1 9574037 9574081 3 +1008 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056739.1 1609929838 1609929871 3 +1000 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056739.1 1863422594 1863422638 3 +944 1022 GCF_019279795.1.2bit:NC_056742.1 209271843 209271920 3 +1000 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056743.1 713103798 713103842 3 +1000 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056743.1 894446025 894446069 3 +1008 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056743.1 1132477093 1132477126 3 +1000 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056744.1 1738591261 1738591305 3 +1000 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056746.1 1367090098 1367090142 3 +1000 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056749.1 230153407 230153451 3 +490 600 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 386787357 386787467 3 +1414 1458 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387416964 387417008 3 +2632 2687 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387722148 387722203 3 +3364 3452 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 387993254 387993342 3 +977 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 496791306 496791372 3 +999 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 77424347 77424391 2 +1021 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 203988686 203988708 2 +1008 1030 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 488951397 488951419 2 +1008 1042 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 687213582 687213615 2 +776 809 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 728639439 728639472 2 +1020 1042 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 872808035 872808057 2 +996 1040 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 926333155 926333199 2 +1021 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 1320816574 1320816596 2 +1970 2210 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 1336589276 1336589518 2 +1020 1042 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 1832435341 1832435363 2 +1025 1047 GCF_019279795.1.2bit:NC_056725.1 1979730291 1979730313 2 +1021 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056726.1 1621014659 1621014681 2 +1011 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056726.1 1715101542 1715101575 2 +1000 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056726.1 1935681528 1935681572 2 +1008 1030 GCF_019279795.1.2bit:NC_056727.1 23845910 23845932 2 +1000 1022 GCF_019279795.1.2bit:NC_056727.1 188581283 188581305 2 +1021 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056727.1 243433839 243433861 2 +3084 3247 GCF_019279795.1.2bit:NC_056727.1 385705111 385705276 2 +1021 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056727.1 825313258 825313280 2 +1008 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056727.1 1091814900 1091814933 2 +1008 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056727.1 1166730895 1166730928 2 +999 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056728.1 512619778 512619822 2 +1000 1022 GCF_019279795.1.2bit:NC_056728.1 552733258 552733280 2 +1003 1047 GCF_019279795.1.2bit:NC_056728.1 666106551 666106595 2 +1020 1042 GCF_019279795.1.2bit:NC_056728.1 1192119907 1192119929 2 +1008 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056728.1 1211207382 1211207415 2 +1019 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056728.1 1478759150 1478759172 2 +1008 1030 GCF_019279795.1.2bit:NC_056728.1 1628854084 1628854106 2 +1019 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056728.1 1880189872 1880189894 2 +1019 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056728.1 1936038225 1936038247 2 +1020 1042 GCF_019279795.1.2bit:NC_056729.1 630966908 630966930 2 +1008 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056729.1 968413347 968413380 2 +1020 1042 GCF_019279795.1.2bit:NC_056729.1 1131416660 1131416682 2 +1000 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056729.1 1131416858 1131416902 2 +1008 1030 GCF_019279795.1.2bit:NC_056729.1 1257677388 1257677410 2 +1021 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056729.1 1354036046 1354036068 2 +1025 1047 GCF_019279795.1.2bit:NC_056730.1 94039374 94039396 2 +1008 1030 GCF_019279795.1.2bit:NC_056730.1 1111839718 1111839740 2 +1008 1030 GCF_019279795.1.2bit:NC_056731.1 130496058 130496080 2 +1020 1042 GCF_019279795.1.2bit:NC_056731.1 234331658 234331680 2 +1025 1047 GCF_019279795.1.2bit:NC_056731.1 1006214682 1006214704 2 +1008 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056731.1 1027639811 1027639844 2 +1025 1047 GCF_019279795.1.2bit:NC_056731.1 1537226405 1537226427 2 +1019 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056732.1 228975043 228975065 2 +1025 1047 GCF_019279795.1.2bit:NC_056732.1 749820247 749820269 2 +1019 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056732.1 761395844 761395866 2 +2136 2277 GCF_019279795.1.2bit:NC_056732.1 858733183 858733326 2 +1020 1042 GCF_019279795.1.2bit:NC_056732.1 862998631 862998653 2 +962 1039 GCF_019279795.1.2bit:NC_056732.1 971065359 971065436 2 +1003 1047 GCF_019279795.1.2bit:NC_056732.1 1158236618 1158236662 2 +1006 1039 GCF_019279795.1.2bit:NC_056732.1 1158284116 1158284149 2 +1021 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056733.1 184016954 184016976 2 +1019 1041 GCF_019279795.1.2bit:NC_056733.1 1248427609 1248427631 2 +1020 1042 GCF_019279795.1.2bit:NC_056733.1 1314066765 1314066787 2 +977 1043 GCF_019279795.1.2bit:NC_056733.1 1749577412 1749577478 2 +1003 1047 GCF_019279795.1.2bit:NC_056733.1 1961969636 1961969680 2 +1011 1044 GCF_019279795.1.2bit:NC_056734.1 252215073 252215106 2 +1025 1047 GCF_019279795.1.2bit:NC_056735.1 441764763 441764785 2 +1025 1047 GCF_019279795.1.2bit:NC_056735.1 480620734 480620756 2 +1001 1034 GCF_019279795.1.2bit:NC_056735.1 516840566 516840599 2 +1008 1030 GCF_019279795.1.2bit:NC_056735.1 538058862 538058884 2 +101 matches