b31907d700c1fe956e4e4c20e64d91de027d7c84 markd Tue May 14 02:03:33 2024 -0700 merge blatHuge implementation diff --git src/gfServer/tests/expected/testHugeProt.out src/gfServer/tests/expected/testHugeProt.out new file mode 100644 index 0000000..5ef2771 --- /dev/null +++ src/gfServer/tests/expected/testHugeProt.out @@ -0,0 +1,60 @@ +tileSize 4 +626 670 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129295776 129295820 9 + 0 + 626 129295776 630 129295780 638 129295788 642 129295792 646 129295796 650 129295800 654 129295804 662 129295812 666 129295816 +736 780 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129325516 129325560 9 + 0 + 736 129325516 744 129325524 748 129325528 756 129325536 760 129325540 764 129325544 768 129325548 772 129325552 776 129325556 +246 302 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129182240 129182296 7 + 0 + 246 129182240 250 129182244 254 129182248 270 129182264 274 129182268 282 129182276 298 129182292 +571 595 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129247272 129247296 6 + 0 + 571 129247272 575 129247276 579 129247280 583 129247284 587 129247288 591 129247292 +119 147 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129138976 129139004 5 + 0 + 119 129138976 123 129138980 127 129138984 135 129138992 143 129139000 +602 626 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129259972 129259996 5 + 0 + 602 129259972 606 129259976 610 129259980 614 129259984 622 129259992 +218 246 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129173488 129173516 4 + 0 + 218 129173488 222 129173492 238 129173508 242 129173512 +537 561 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129240716 129240740 4 + 0 + 537 129240716 549 129240728 553 129240732 557 129240736 +467 499 GCF_019279795.1.2bit:NC_056744.1 424468248 424468280 3 + 0 + 467 424468248 475 424468256 495 424468276 +469 497 GCF_019279795.1.2bit:NC_056745.1 278283864 278283892 3 + 0 + 469 278283864 477 278283872 493 278283888 +88 100 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129123868 129123880 3 + 0 + 88 129123868 92 129123872 96 129123876 +150 218 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129156008 129156076 12 + 1 + 150 129156008 154 129156012 158 129156016 162 129156020 174 129156032 178 129156036 190 129156048 194 129156052 198 129156056 202 129156060 210 129156068 214 129156072 +466 498 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129225956 129225988 8 + 1 + 466 129225956 470 129225960 474 129225964 478 129225968 482 129225972 486 129225976 490 129225980 494 129225984 +387 435 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129195316 129195364 7 + 1 + 387 129195316 391 129195320 399 129195328 403 129195332 415 129195344 427 129195356 431 129195360 +16 64 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129066436 129066484 6 + 1 + 16 129066436 20 129066440 40 129066460 52 129066472 56 129066476 60 129066480 +150 206 GCF_019279795.1.2bit:NC_056744.1 424385588 424385644 4 + 1 + 150 424385588 158 424385596 194 424385632 202 424385640 +65 85 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129105476 129105496 4 + 1 + 65 129105476 69 129105480 77 129105488 81 129105492 +159 215 GCF_019279795.1.2bit:NC_056745.1 283337156 283337212 3 + 1 + 159 283337156 199 283337196 211 283337208 +869 897 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129342452 129342480 3 + 1 + 869 129342452 877 129342460 893 129342476 +672 732 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129300908 129300968 13 + 2 + 672 129300908 680 129300916 684 129300920 688 129300924 692 129300928 696 129300932 700 129300936 704 129300940 712 129300948 716 129300952 720 129300956 724 129300960 728 129300964 +315 375 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129186600 129186660 12 + 2 + 315 129186600 319 129186604 323 129186608 327 129186612 331 129186616 335 129186620 343 129186628 347 129186632 351 129186636 355 129186640 367 129186652 371 129186656 +781 817 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129331084 129331120 7 + 2 + 781 129331084 785 129331088 789 129331092 793 129331096 797 129331100 809 129331112 813 129331116 +820 852 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129334792 129334824 7 + 2 + 820 129334792 824 129334796 828 129334800 832 129334804 836 129334808 840 129334812 848 129334820 +498 530 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129229856 129229888 6 + 2 + 498 129229856 506 129229864 510 129229868 514 129229872 518 129229876 526 129229884 +439 463 GCF_019279795.1.2bit:NC_056751.1 129224900 129224924 5 + 2 + 439 129224900 443 129224904 447 129224908 451 129224912 459 129224920 +469 497 GCF_019279795.1.2bit:NC_056745.1 259435452 259435480 3 + 2 + 469 259435452 477 259435460 493 259435476 +382 434 GCF_019279795.1.2bit:NC_056745.1 363765004 363765056 6 - 2 + 382 363765004 386 363765008 402 363765024 418 363765040 426 363765048 430 363765052 +150 206 GCF_019279795.1.2bit:NC_056745.1 363597036 363597092 5 - 2 + 150 363597036 178 363597064 194 363597080 198 363597084 202 363597088 +467 499 GCF_019279795.1.2bit:NC_056745.1 363840316 363840348 4 - 2 + 467 363840316 471 363840320 475 363840324 495 363840344 +29 matches